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全球首个万种原生生物基因组计划在汉发动

放大字体  缩小字体 时间:2019-12-30 19:56:49 来源:自媒体 作者:看荆楚

原标题:全球首个“万种原生生物基因组方案”在汉发动

来历: 湖北日报

湖北日报讯(记者文俊、通讯员孙慧)30日,全球首个“万种原生生物基因组方案”(Protist 10,000 Genomes Project, 简称P10K)正式对外发布。该项目由中国科学院水生生物研讨所联合西藏大学、河南农业大学、中国农业科学院兰州兽医研讨所、中国科学院北京基因组研讨所和华中科技大学等单位一起建议,旨在制作万种代表性原生生物基因组图谱,树立一个大规模的原生生物遗传资源数据库。

原生生物是生物五界(植物界、真菌界、动物界、原生生物界和原核生物界)之一,主要是由单细胞真核生物组成的一大类群,包含单细胞真核藻类和原生动物等,已描绘的物种数超越6万种,不知道品种更难以估计。原生生物的散布极为广泛,只需有水的当地,就有原生生物的存在。原生生物是水生态系统的重要组分,其间的藻类贡献了地球上近50%的光合行为;它们也是水产动物和人类的优秀饵料和养分品;别的,部分甲藻和硅藻的“疯长”会构成河流和海洋的有毒藻华,带来严峻的环境问题。一起,许多原生生物是人、畜禽和水产动物的重要致病性寄生虫,如构成人疟疾的疟原虫、昏睡病的锥虫、鸡球虫病的球虫,构成鱼白点病的小瓜虫等等。

在根底生物学研讨方面,一些原生生物作为形式生物做出了重要贡献。例如在嗜热四膜虫中发现的核酶以及端粒和端粒酶别离获得了1989年和2009年的诺贝尔奖。但是,现在已揭露宣布了基因组数据的原生生物仅400余种。

我国原生生物学研讨始于上世纪20年代,中国科学院水生生物研讨所作为我国原生生物学(原生动物学和藻类学)的发源地,在王家楫院士、饶钦止先生、倪达书先生、黎尚豪院士和沈韫芬院士等一代代科学家的带领下,一向引领着我国原生生物学相关研讨范畴的展开。现在,水生所不只具有一支在国内外有重要影响的原生生物学研讨团队,并且建有保藏了2500余种株真核藻类和近600种株原生动物的国家藻类和原生动物种质库(National Culture Collection of Algae and Protozoa),近年来依托原生生物基因组测序和生物信息剖析渠道已完成了500余种原生生物的基因组测序。

此次,水生所牵头发动的“万种原生生物基因组方案”是国际上初次针对原生生物界的大规模基因组测序方案。该方案将依托各建议单位保藏的3000多种株真核藻类和原生动物的种质资源,经过继续的样品收集和宏基因组数据发掘,在未来3年(2020—2022年)完成约一万种原生生物的基因组测序和剖析,将包含原生生物悉数26个门/类,掩盖超越85%的纲、60%的目和30%的科属。据了解,该方案将以敞开联盟形式运转,欢迎国内外有爱好的研讨团队参加。

“万种原生生物基因组方案”的展开,将对了解生物多样性构成机制、多细胞生物/有性生殖的来源与演化等严重根底生命科学问题,促进国家科技资源共享服务渠道的信息互联互通,以及推进与生态环境保护、养分健康和疾病防治相关原生生物种质传资源的发掘与使用实践具有重要意义;在科学发现、决议计划支撑、资源共享和科普宣扬等方面发挥及其重要的效果。

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